熱電色譜柱在色譜法中存在兩相，一相是固定不動的，我們把它叫做固定相；另一相則不斷流過固定相，我們把它叫做流動相。色譜法的分離原理就是利用待分離的各種物質在兩相中的分配系數、吸附能力等親和能力的不同來進行分離的。

 

　　含有樣品的流動相液體通過一固定于柱子或平板上、與流動相互不相溶的固定相表面；當流動相中攜帶的混合物流經固定相時，混合物中的各組分與固定相發生相互作用。

 

　　由于混合物中各組分在性質和結構上的差異，與固定相之間產生的作用力的大小、強弱不同，隨著流動相的移動，混合物在兩相間經過反復多次的分配平衡，使得各組分被固定相保留的時間不同，從而按一定次序由固定相中先后流出。與適當的柱后檢測方法結合，實現混合物中各組分的分離與檢測。

 

　　熱電色譜柱的柱子接反了怎么辦？如果柱子質量比較好，理論上沒有影響，如果柱子質量不好，可能會導致分離度下降、柱效降低。一般說來色譜柱不能反沖，只有生產者指明該柱可以反沖時，才可以反沖除去留在柱頭的雜質。否則反沖會迅速降低柱效。

 

　　一般液相色譜柱是有方向的，通常情況下只能按照其規定流向通過流動相，尤其當色譜柱填充質量不高的時候。比如實驗室自制色譜柱、使用壓力高的色譜柱等。這類色譜柱的進口端一般會有一定的凹陷，如果反過來使用，會導致色譜柱填料的塌陷，產生柱效降低等后果。

 

　　但是如果制備良好的色譜柱，比如熱電色譜柱，在進了比較臟的樣品后，可以反沖洗來沖出雜質。